Es la enzima más abundante de la leche. En el organismo es secretada por las glándulas mamarias y las glándulas salivales. Su concentración aumenta cuando disminuye la disponibilidad de otras enzimas protectoras como son las lisozimas, lactoferrina o las inmunoglobulinas.
La lactoperoxidasa presenta una gran capacidad de oxidar el tiocianato en presencia de peróxido de hidrógeno. Durante estas reacciones se producen metabolitos intermedios, los cuales interviene en el sistema de transporte de energía y la respiración de las bacterias, virus, hongos, limitando su crecimiento e induciendo la muerte celular, de ahí su poder bactericida y bacteriostático.