Se utiliza para prevenir el crecimiento de Escherichia coli en el tracto gastrointestinal ya que libera una sustancia denominada reuterina, con gran capacidad antimicrobiana selectiva.
Existe evidencia científica que demuestra la efectividad del L. reuteri en el tratamiento de la diarrea en niños, como coadyuvante en el tratamiento de Helycobacter pylori y para reducir la formación de caries en dientes y muelas.